Suomessa harjusta tavataan Suur-Saimaan alueella, Höytiäisessä, Pielisessä, Päijänteen pohjoisosissa ja Oulujoen vesistöstä pohjoiseen sekä Pohjanlahdessa, jossa runsaimmin Perämeressä. Tunturialueella ylin järvi, jossa harjusta esiintyy on käsivarressa oleva Siedjomjavri, joka sijaitsee 712,3 metriä merenpinnan yläpuolella.